黒の組織が壊滅して解毒薬が完成するとコナンは新一に戻り灰原哀とメアリー世良も元の姿に戻った。やがて新一と蘭は帝丹高校卒業後は大学を経て探偵事務所を設立すると結婚した。
それからほどなくして娘が誕生して工藤家は子育てをしながら探偵業に勤しんでいた。
一方志保は毒薬を開発してたことと間接的な毒殺で逮捕されて無期懲役を求刑された。彼女は控訴しようとしたが阻まれてそのまま服役した。
そんなある日新一と蘭が結婚して子供を授かったことを偶然知った志保は世の中への怒りから看守の目を盗んではトンネルを掘り続けると脱獄に成功した。
新一と蘭は保育園から娘を連れ帰っていると目の前に志保が現れた。彼女は突然娘を人質に取って立てこもった。
「てめえらが離婚したら娘を助けてやる。」
「バーロー！誰がオメーの要求なんか飲むか！」
「新一？」
新一の反発に蘭はどうすればいいのかわからなかった。
「だったらこのガキ殺してやる！」
志保が娘に殴りかかろうとすると娘は志保に肘打ちすると飛び蹴りして吹っ飛ばした。娘のあまりの潜在能力の強さに新一と蘭はしばし唖然としたと同時にコナンだったころに蘭が盗賊団に人質にされたときのことを思い出していたのだった。
その後娘が10歳ぐらいになると新たに息子を授かって工藤家は二人の子宝に恵まれた。息子が帝丹小学校に進学した頃娘は帝丹高校に通っていてその姿はかつてのコナンと蘭のようだった。二人の関係性を見た新一と蘭は感慨深そうにしていた。
一方警察に捕まった志保は処刑場に連れていかれると日本刀でバラバラに切り裂かれて死亡したのだった。
終わり